تأخذ البروتينات بعد تركيبها على مستوى الريبوزومات بنيات فراغية محددة لتؤدي وظيفتها داخل أو خارج الخلية
إن الوحدات البنائية للبروتين هي المسؤولة عن تحديد مستوى البنية الفراغية الممثلة في الوثيقة (1)
يمثل الشكل (أ) جذور بعض هذه الوحدات ، بينما الشكل (ب) قيم ال
انسب لكل حمض أميني قيمة ال
قيمة
الحمض الأميني | التعليل | |
$$R1$$ | 3 | حامضي |
$$R2$$ | 5 | متعادل |
$$R3$$ | 9.8 | قاعدي |
$$R4$$ | 10.8 | قاعدي قوي |
ماهي نتائج الهجرة الكهربائية للأحماض الأمينية التي جذورها (R1 ، R2) عند
نتيجة الهجرة الكهربائية :
قطرة الحمض الأميني ذو الجذر $$R1$$ تتحرك بإتجاه القطب الموجب
التعليل :
بما أن
قطرة الحمض الأميني ذو الجذر $$R2$$ تبقى ساكنة في نقطة الانطلاق .
التعليل :
لأن
اكتب الصيغ الكيميائية لهذين الحمضين الأمينين في نفس الوسط 5=
كتابة الصيغ الكيميائية :
اكتب الصيغ الكيميائية لرباعي البيبتيد الذي جذور أحماضه الأمينية كالتالي ( R1-R2-R3-R4 )
كتابة الصيغة الكيميائية لرباعي البيبتيد الذي جذور أحماضه الأمينية ($$R2-R1-R3-R4$$ ) :
أحسب عدد أنواع رباعي البيبتيد الذي يمكن تركيبه من الوحدات البنائية ذات الجذور المبنية في الشكل (أ) من الوثيقة (1) بدون تكرار الحمض الأميني ، و بتكرار الحمض الأميني
عدد أنواع رباعي الببتيد بتكرار الحمض الأميني : 44= 256
عدد أنواع رباعي الببتيد بدون تكرار الحمض الأميني : 24 = 1*2*3*4
ماذا تستنتج ؟
الإستنتاج :
تنوع البروتين مرتبط بعدد و نوع و ترتيب الأحماض الأمينية .
تعرّف على مستوى البنية الممثلة في الشكل (ج) من الوثيقة (1) .
التعرف على مستوى البنية الممثلة في الوثيقة (ج) : بنية ثالثية .
تنشأ بين الأحماض الأمينية أنواع من الروابط بعضها ممثل في الشكل (ج) من الوثيقة (1)
استنتج أنواع هذه الروابط (َA, B) . ثم اقترح أنواعا أخرى .
إستنتاج أنواع هذه الروابط (
اقتراح نوع آخر من الروابط تجاذب الجذور الكارهة للماء ، رابطة هيدروجينية .
ما أهمية هذه الروابط ؟
أهمية هذه الروابط : تحافظ على تماسك و إستقرار البنية .
نعامل بروتين وظيفي باليوريا و بيتا مركبتو إيثانول كما هو ممثل للوثيقة (2) .
حلّل الوثيقة
تحليل الوثيقة :
التجربة الأولى :
المرحلة الأولى :
بإضافة بيتا مركبتو و اليوريا ، تكسرت الجسور الكبريتية و زال الإنطواء الطبيعي و بالتالي فقد البروتين بنيته الفراغية الوظيفية .
المرحلة الثانية :
بإزالة المادتين ، إستعاد البروتين بنيته الفارغية الطبيعية حيث تشكلت الجسور الكبريتية في مواقعها الصحيحة .
التجربة الثانية :
المرحلة الأولى : نفس النتيجة
المرحلة الثانية : بإزالة بيتا مركبتو و بقاء اليوريا حدث إنطواء غير طبيعي للبروتين و تشكلت الجسور الكبريتية في غير مواقعها الصحيحة و بذلك البروتين إكتسب بنية فراغية غير وظيفية .
من خلال تحليلك للوثيقة و ما سبق بيّن على ماذا تتوقف البنية الفراغية الوظيفية للبروتين .
تتوقف البنية الفراغية الوظيفية للبروتين على مايلي :
وفق عدد و نوع و ترتيب الأحماض الأمينية للسلسلة البروتينية ، يكتسب بنية فراغية وظيفية في الوسط الملائم ، حيث تنشأ الروابط في مواقعها الصحيحة .